Чтобы оставить в меню только то, что действительно нужно, найдите ветвь: HKEY_CLASSES_ROOT\*\ shellex\ContextMenuHandlers - в ней в качестве подразделов выступают команды, отображаемые в меню любого файла. Просто удалите то, то вам не нужно.
Команды, привязанные к конкретному типу файлов можно найти уже в ветвях, соответствующих такому типу. Например, для файла AVI это будет раздел HKEY_CLASSES_ROOT\ avifile\ shell.
За меню папок же отвечают HKEY_CLASSES_ROOT\ Directory\shell и HKEY_CLASSES_ROOT\ Folder\shell